Το 5o Γυμνάσιο Αλεξανδρούπολης ιδρύθηκε το έτος 1989. Στεγάστηκε αρχικά στο κτίριο του παλιού Κλασσικού Λυκείου, το σημερινό 6ο Πειραματικό Γυμνάσιο Αλεξανδρούπολης, ως το μόνο πρωινό Γυμνάσιο της πόλης. Το έτος 1991 μεταφέρθηκε σε νέο κτίριο κοντά στην παλιά Υ.Ε.Β., επί της οδού Γ. Καρτάλη 10, όπου λειτουργεί μέχρι σήμερα.
Το 5o τμήμα κάθε τάξης αποτελούσε το «Αθλητικό τμήμα» μέχρι το σχολικό έτος 2010, καθότι το 5o Γυμνάσιο φιλοξενούσε και Τμήματα Αθλητικής Διευκόλυνσης (Τ.Α.Δ.).
Το σχολείο διαθέτει -εκτός από τις αίθουσες διδασκαλίας- δύο (2) εργαστήρια Πληροφορικής, εργαστήριο Φυσικής-Χημείας, βιβλιοθήκη, εργαστήριο Τεχνολογίας και ευρύχωρη αίθουσα πολλαπλών χρήσεων. Ο αύλειος χώρος που το περιβάλλει είναι μεγάλος και κατάφυτος. Οι μαθητές & μαθήτριες μπορούν στα διαλείμματα να ξεκουράζονται σε γωνιές σκιερές και δροσερές, ενώ την ώρα της Φυσικής Αγωγής έχουν τη δυνατότητα να αθλούνται σε γήπεδα μπάσκετ, βόλεϋ, ποδοσφαίρου, καθώς και στο παρακείμενο σκάμμα. Η προκάτ αίθουσα εξυπηρετεί αυτή τη στιγμή τις ανάγκες του μαθήματος των Εικαστικών.
Ο σύλλογος καθηγητών σήμερα απαρτίζεται από σαράντα (40) περίπου διδάσκοντες/ουσες
Στο σχολείο διετέλεσαν Διευθυντές από ιδρύσεώς του, οι κκ Πουλουτίδης Γρηγόριος, Πετρόπουλος Νικόλαος, Παπαλαμπίδης Αθανάσιος, Κατσίκιας Νικόλαος, Μπίκος Χρήστος, ενώ σήμερα το σχολείο διευθύνει η κα Μπιλιμπίνη Ευτέρπη.